Подскажите если я прилечу в Марокко, а от туда обратным рейсом через Испанию, у меня получится выйти в Испании и остаться там?

Если нет визы, то нет)

Что именно вы имеете ввиду под словом нет, не пустят в самолёт, либо не выпустят с аэропорта, в чём проблема если я там буду находиться нелегалом?

Не впустят в самолет если нет хотя бы транзитной визы

Даже если вы как-то долетите до Испании, то вам нужно будет пройти паспортный контроль по прибытию. Без визы вы его не пройдете.