Добрый вечер, подскажите кто знает, на выезде из России в Грузию за рулём должен находиться собственник автомобиля или необязательно

Не обязательно

Если собственник с вами в машине,то может проехать водитель с правами(ВУ).

Собственник же пешеходом через границу в это время проходит. Это не влияет на пропуск автомобиля?

Если потребуют,собственник подойдёт.

В такой ситуации чаще всего проблем не возникает. Я бы сказала так: если собственник машины (жена) физически присутствует на границе — даже если она идёт пешком через здание пропускного пункта, а за рулём муж, — нотариальная доверенность на управление автомобилем не требуется.
Как это обычно работает на практике: пограничники проверяют документы. Они видят свидетельство о регистрации транспортного средства (где собственником указана жена) и паспорт жены. Её просят подойти к окошку для проверки, паспорт смотрят, после чего могут вернуть в очередь пассажиров, а муж с машиной проходит контроль отдельно. Грузинской стороне в целом без разницы, кто физически за рулём, если подтверждён статус собственника.