Есть банки в Словении, которые открывают (корп. или личные) счета с паспортом РФ?

Есть, но со скрипом. Лучше для этого рассмотреть онлайн банки типа Револют, Bunq и так далее...

Они подходят для юр. лиц в Словении?

Потом не ликвидируют компанию за отсутствие корп. счета в словенском банке?

Словенские госорганы обязаны принимать любой IBAN из стран еврозоны. Главное, чтобы об этом счёте знала словенская налоговая.