Здравствуйте, а есть опыт отправки паспорта из Астаны в Алматы? Насколько дольше приходят, чем в Астане?

Пару дней больше. Паспорт сначала поступает в пункт выдачи, а потом его отправляют в Алматы. Но так было давно, давно таких отзывов не было.

Вот думали из астаны улететь в алматы, по озерам поездить и оттуда в Москву, чтоб обратно не лететь в астану.

Вы просто указываете в личном кабинете пункт выдачи в Алматы.
Это бесплатно.
И я бы сделал так же.