Добрый вечер. Такой вопрос, чтобы получить защиту нужно обязательно сейчас регестрироваться? Австрия

Да, конечно

То есть, если регестрироваться сейчас, то нужно будет ещё потом через 2 недели приходить туда, правильно понимаю?

Вы регистрируетесь там, где собираетесь оставаться. в Вене, значит, в Вене. В другом городе/стране - значит, там.
возможно и снова прийти, как скажут.