Добрый вечер! Есть какая-то большая разница между Luxexpress и Baltic shuttle?
И как вообще происходит процедура прохождения границы из РФ на автобусе? Эстония

Способ перемещения через границу не особо влияет на процедуры...
На Балтик Шатле можно с животными, если у Вас аллергия на шерсть или перья - лучше выбрать автобус иного перевозчика.
Но их огромный плюс - прямая довозка до основных спа-отелей. Они как автобусы с аэропортов южных стран от туроператоров - последовательно до отелей довозят хотя и отклоняются при этом от трассы до Нарва-Йыэссу и Тойлы...